Auf der Suche nach einer der interessantesten Antworten auf die Frage der Menschheit: “Sind wir wirklich allein im Universum?”, fliegt in einer fernen Zukunft und im Auftrag des fiktiven Weyland-Konzerns eine Crew unter Leitung von Dr. Elizabeth Shaw (Noomi Rapace) in die Weiten des Alls, um sich auf die Suche nach einer außerirdischen Zivilisation zu begeben – deren Spuren auf der Erde entdeckt wurden und die physisch sogar größer sein könnten, als die sogenannten Xenomorphen.
An Bord des gigantischen Terraforming-Raumschiffs PROMETHEUS befindet neben Meredith Vickers (Charlize Theron), der Vertreterin des Weyland-Konzerns, auch ein hochentwickelter Android namens David (Michael Fassbender). Rein äußerlich ist er von der restlichen Crew nicht mehr zu unterscheiden – dennoch wird “David” eine wichtige Schlüsselfigur im Überlebenskampf zwischen der menschlichen Besatzung und den Außerirdischen sein.
Dann ist es soweit: Im Jahr 2085, Lichtjahre von der Erde entfernt, stößt die Mannschaft der PROMETHEUS unter der Führung ihres Raumschiff-Kommandanten Captain Janek (Idris Elba) tatsächlich auf den Heimatplaneten einer fremden Zivilisation. Doch die Außerirdischen sind alles andere als erfreut über den menschlichen “Besuch” und das machen sie auch unmissverständlich deutlich. Zudem verfügen die Aliens über eine unbekannte und sehr aggressive Biowaffe, welche sie gnadenlos gegen die Besatzung der PROMETHEUS einsetzen.
Bald darauf wird die mentale Belastbarkeit der Crew auf eine harte Probe gestellt und sie müssen leidvoll erkennenn, dass die Gier nach Wissen und Fortschritt größer als der Verstand war…