Nachdem Sabretooth die Freundin von Logan Kayla Silverfox aufgesucht und getötet hat sucht Logan ihn in einer Bar auf, wo es zum ersten Aufeinandertreffen kommt.
Am Ende des Kampfes wird Logan auf einen vorbeifahrenden LKW geworfen und hier setzt auch der Schnitt ein.
In der Uncut Fassung sieht man wie Logan vom LKW auf die hintere Ladung fällt und gegen verschiedene Hindernisse stösst bevor er dann endgültig zu Boden fällt!

Nach der Operation von Logan, der dann zu Wolverine wird, bricht er aus dem Becken aus und bekommt von Agent Zero einen Kopfschuss.
In der Cut Fassung ist keine Wunde zu sehen, in der ungeschnittenen Fassung sieht man eine offene Wunde mit dem Adamantium im Hintergrund!
Soweit ich weiß ist dieser Schnitt NUR in einigen Trailer zu sehen.

Die Erschießung des älteren Ehepaars ist auch länger und zwar bei der Erschießung von der Oma. In der Cut Fassung bekommt sie einen Schuss ab und fällt dann um. In der Uncut Fassung bekommt sie zwei Schüsse in den Rücken und den zweiten Schuss sieht man im Rücken eintreffen!

Nachdem Wolverine den Hubschrauber zum Absturz gebracht und mit Stryker geredet hat setzt die Schere an.
Agent Zero, der im Heli eingeklemmt ist, redet noch kurz mit Wolverine, der ihm sagt, dass dieses ältere Ehepaar anständige und unschuldige Menschen gewesen sind.
Daraufhin dreht sich Wolverine um und bekommt von Agent Zero nachgesagt: "Alle unschuldigen Menschen sterben um dich herum!".
Die bekannte Szene aus dem Trailer setzt ein, wo Wolverine durch einen Funken die Benzinspur anzündet und den Heli zum Explodieren bringt. Bei der Explosion kann man ein Schrei von Agent Zero hören.

Als Sabretooth im Kampf John Wraith tötet und auf ihm einredet läuft die Szene entschieden länger, er redet deutlich länger auf ihn ein.

Am Ende erschießt Stryker mit Adamantium-Kugeln Wolverine.
In der Luft schießt er Wolverine eine Kugel in den Kopf, als er am Boden liegt zielt er erneut auf den Kopf und es folgt ein Schnitt auf die am Boden verletzt liegende Kayla Silverfox und man kann den zweiten Schuss nur akustisch hören.
In der Uncut Fassung setzt Stryker den zweiten Schuss an und es folgt ein entfernter Kamerawechsel, der zeigt, wie Stryker dem liegenden Wolverine ein zweites Mal in den Kopf schießt!